染色体をマッピングするための5つの自動核型分析ソフトウェア

核型分析は、個体の全染色体「地図」の包括的な見解を得るために、生物中に見出される全染色体の順序付けおよび対合のプロセスである。

しかし、最初に染色体が何であるかを理解するようにしましょう。 染色体は、体の各細胞の核内に含まれている糸に似た構造です。

各染色体構造はあなたの体の全体の遺伝情報計画を含みます。 これはあなたの体がどのように構成されているか、刺激に反応しているか、病気にかかりやすいかなどを決定します。 女性には2つのX染色体があり、男性には1つのX染色体と1つのY染色体があります。 あなたの体の各細胞は23組の染色体、合計46本の染色体を含んでいます。

研究者が各患者の染色体の配列を理解できるようにするために、彼らは核型分析ソフトウェアを使用する。 この種のソフトウェアは、染色体分析を実行するように設計されており、人の染色体の構造と数を評価します。 こうすることで、研究者や科学者は異常を検出することができます。

この記事では、核型分析を実行できるようにするための優れたソフトウェアの選択肢をいくつか紹介します。

2019年に使用する上位5つの自動核型分析ツール

1

ArgusSoft

ArgusSoftは、ヒト染色体をバンド位置によって自動的に核型分析することを可能にする優れたソフトウェアオプションであり、動物や植物の染色体をオンラインで核型分析するのにも使用できます。

主な機能：

• G、Q、R染色
• 曲がりを認識したヒト染色体の自動核型分析
• ブタ染色体の自動核型分析
• さまざまなクリアランスレベル - 400、550、および850レベルを持つ、ヒト染色体の標準表意文字の3つの組み込みベース
• 他の動植物種用の標準クロモソーム表意文字の基本を追加できます
• サンプル調製方法
• カメラとスキャナーを使用した中期プレート画像の入力
• グラフィックを伴う画像の添付
• 適用および接触染色体の自動分割
• 染色体と表意文字の比較

また、ArgusSoftを使用して、事前設定された準備を使用して染色体認識システムをトレーニングしたり、内蔵データベースに中期プレート画像やカリオグラムを転送したり、レポートのパターンを作成したり、カリオグラムを修正したりできます。

あなたは彼らの公式ウェブサイトからArgusSoftを使用するためのトレーニングとサポートを受けることができます。 サポートセンターにはトレーニング、メンテナンス、コンサルティングサービスが含まれています。

ArgusSoftをお試しください

2

応用スペクトルイメージングによるHiBand

HiBandはApplied Spectral Imagingによって開発されたソフトウェアで、デジタル核型分析機能を使用して高度な染色体分析を実行できます。 このソフトウェア

染色体構造の詳細な分析に自動スキャン機能を使用します。

HiBandのさまざまな機能を使用して、結果データの索引付け、数え上げ、保管、および管理を行うことができます。 この強力なソフトウェアを使用して染色体配列を自動的にスキャンすることもできます。

HiBandで見つかった核型分析機能を使用して得られた結果は、パスワードで保護され暗号化されたレイヤーを使用して安全な場所に保管することができます。 これにより、重要なシーケンスデータを失うことについての安心感が得られます。そのため、ラボの効率も向上します。

結果のソートは非常に簡単な方法で行われ、染色体の特定のシーケンスを検索するだけでよく、すべての結果は簡単にアクセスして変更、確認、およびその他のタグへの追加を行うことができます。ファイルの。

主な機能：

• 明視野核分析 - GバンドとRバンド
• 蛍光核型分析 - Qバンド、Rバンド、およびFISH
• スペクトル核型分析
• 自動染色体カウント
• 染色体の索引付けと分類
• 染色体の高度な分離と高度な画像強調
• 画像ギャラリー - すべてのケースの中期と核型を1つの画面に表示できます
• 染色体を比較することができます - それらを並べて参照してください
• 異常な表意文字 - 染色体、セル、表意文字、注釈を画像ジェネレータに追加できます。

HiBandは、ラボ効率の向上のために完全に自動化されたワークフローを使用し、「すぐに使える」スキャン機能、メタフェーズの検索、自動バーコード読み取り、スライドスキャン中のリアルタイムアップロード、ラボLIS Central Portalへのエクスポートを行います。データベース

HiBandを試す

3

MetaSystemsによるIkaros

この核型分析システムは、1画面にすべての機能を提供する非常に直感的なユーザーインターフェースを備えています。 これにより、取得したすべての情報に簡単かつ迅速にアクセスできます。

IkarosはNeonと一緒に使用できます。Neonは、画像データとケースの整理に役立つように設計されたプラットフォームです。 Neonは、すべてのイメージングジョブ、外部ソースからデータを収集し、ケース管理ダッシュボードを使用してわかりやすい方法でそれらを提示することを可能にします。

このツールを使用すると、重要な情報を常に手元に置いて安全に保管することができますが、非常に強力なデータ管理アルゴリズムが使用され、データを観察するためのさまざまな方法があります。

Neonに関する詳細情報をチェックしてください。

Ikarosは、Brightfield G-BandとR-Band、Fluorescence Q-Band、R-BandとFISHなど、さまざまなバンディング手法をサポートしており、人間、植物、動物向けに事前定義されたカリオグラム形式を多数提供します。 これらのフォームを簡単に編集して、行っている研究の種類に必要なデータを追加できます。

染色体をクラスまたはカリオグラムで比較できるという事実は、違いを簡単に識別できるようにする非常に有用な情報を提供します。

イカロスを試す

4

Micropticによるメタクラス

MetaClassはモジュラー方式で設計されている素晴らしい核型分析ソフトウェアです。 このソフトウェアは、染色体の核型分析およびFISH研究を行うのに役立ちます。

MetaClassは以下のモジュールから構成されています。

• メタクラスデータベース

MetaClassのどのモジュールでもインストールできるデータベース。 あなたは患者の詳細を保存することができ、あなたは結果に簡単にアクセスすることができます。 このモジュールを使えば、どの言語でもカスタマイズしたレポートを作成できます。

• メタクラス核型分析

分裂中期の準備段階の画像をデジタルで取り込んだ後に核型を研究し、サイズ、位置などに基づいてそれらをペアにすることができます。このモジュールは、染色体バンドに関して優れた品質の結果をもたらします。プロ並みのレポートを提供します。

主な機能は次のとおりです。

• 核型の研究は明視野100倍の倍率で分析される
• 複数の中期画像を撮影できます
• 画質は鮮明な結果に変更可能です
• 染色体の自動分類
• 4画面表示 - 中期、核型、未分類の染色体ウィンドウ
• 染色体プロトタイプを表示できます
• 分類されていない染色体は自動または手動で修正することができます - 重ね合わせ、分離、交差、回転など
• MTCセッションファイルまたはBMPイメージはいつでも保存および再ロードできます
• 個々の染色体をメタクラスデータベースにエクスポートして、コメントやメモを追加することができます。

これがMetaclassの核型分析レポートの例です。

• メタクラスFISH

これは、蛍光IN SITUハイブリダイゼーション（FISH）画像を取得することを可能にする分析モジュールです。 このモジュールは、蛍光DNAプローブを使用して画像をキャプチャし、トリソミー、マクロ選択、染色体再配列などの遺伝的異常を確認することを可能にします。

FISH画像は100倍の倍率で分析され、より広い範囲の画像を明瞭にするために、さまざまなフィルタで画像を取り込むこともできます。

上記のモジュールや他の機能についてもっと知りたいなら、MetaClassカタログを見てください。

あなたが好奇心旺盛なタイプで、FISHメソッドを使って得られたレポートを見たいのであれば、

サンプルPDFファイル

メタクラスを試す

5

GenASisバンドビュー

GenASis Bandviewは、さまざまな機能を持つモジュールから構築されているもう1つの優れた核型分析ソフトウェアです。 あなたは核型分析診断を実行し、正確なテスト結果を得るためにこのアプリを使うことができます。

このソフトウェアを使用すると、会社のニーズと達成しようとしている目標に応じて、ワークフローと診断プロセスを完全にカスタマイズできます。

BandViewで提供されるツールの広い範囲は、マウスをワンクリックするだけで簡単にアクセスでき、強力なG / R / C / Qバンドの核型分析の経験を提供します。 あなたはそれがメタフェーズと画像をキャプチャすることになると自動化または手動のワークフローのどちらかを選択できます。

染色体異常が発見された場合、それは患者の遺伝物質の追加、欠失、または再配列によって観察することができる。 BandViewでは、FISH分子技術のバンドを使用することができます。

FISHは蛍光プローブを使用して染色体のさまざまな部分に付着させるので、ソフトウェアは特定のDNA配列に見られる異常部位を検出して位置を特定することができます。

GenASis Bandviewをお試しください

結論

この記事では、2018年末に市販されている最高の自動核型分析ソフトウェアをいくつか調べました。

この記事で取り上げた核型分析ソフトウェアのオプションには、会社の目標を達成するのに役立つさまざまな機能があります。

この種のソフトウェアを使用することで、何千もの染色体構造を迅速に数え、さまざまな専門的技術を用いて分析し、異常を簡単に識別できるようにする高品質のレポートを作成できます。

このトップ5のリストに掲載されているソフトウェアについて、あなたの意見が何であるかを調べてみたいと思います。 下記のコメント欄を使用して私達に知らせてください。

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